深圳市足球俱乐部于1994年1月26日正式挂牌,实行会员制。
1996年,深圳飞亚达公司赞助深圳足球队,深圳队以深圳飞亚达队的队名参加比赛。
1997年1月,中国平安保险股份有限公司全资收购深圳市足球俱乐部,李钢任董事长,深圳队以深圳平安队的队名参加了1997年甲B联赛和1998、1999年甲A联赛。
2000年1月,孙健一就任深圳市足球俱乐部第二任董事长。
2000赛季,中国科健股份有限公司与中国平安保险公司并列冠名深圳足球队,球队以深圳平安科健队的队名参加比赛。
深圳足球俱乐部是深圳经济特区成立以来在体育领域的最大成就,为深圳的精神文明建设,丰富群众的业余文化生活、推动全民健身活动的开展起到了巨大的作用。近来年,深圳坚持经常训练和比赛的业余足球队达数百支,很多的企业都将成立足球队,进行友谊比赛当作增强员工凝聚力、联络企业之间的感情、提高员工身体素质的途径。与此同时,深圳的足球市场也得到了很大的发展,到现场看球和观看电视直播的观众成倍增长,各种与足球有关的酒巴、体育用品商店、业余足球培训如雨后春笋涌现,使深圳流动着浓厚的足球文化。
深圳足球俱乐部自成立7年以来,先后有胡之刚、周穗安、刘建江、路建人、肖笃寅、张增群、车范根、塔瓦雷斯、朱广沪等人担任过主教练,但其中只有胡之刚、车范根、朱广沪3人取得了不同程度的成功。 胡之刚是深圳足球队的第一任主教练,他将这支刚成立的球队在两年时间里就带到了甲A的行列,创造了中国足坛的深圳速度。车范根98年初接手深圳平安队时,球队队员严重老化,但车范根率领这支老八路球队连续两年保级成功,殊为不易。朱广沪2000年中期当球队处在危难之时中途接手球队,调动了球队的士气,稳定了球队的打法,培养了一批年轻队员,并率队打出了历史最佳成绩。